研究

新陈代谢

  • 赖氨酸代谢对植物细胞能量状态具有交叉调节作用
  • 植物芳香族氨基酸代谢的调控
  • 一种新的生物信息学工具来研究分支代谢途径的调控
  • 植物代谢的动态群落:http://metwork.weizmann.ac.il

自噬

  • 与自噬相关的新植物蛋白

氨基酸代谢

赖氨酸代谢对植物细胞能量状态具有交叉调节作用

我们发现,促进赖氨酸的合成并阻止其降解,会导致三羧酸循环代谢产物的大量减少,暴露出赖氨酸代谢和能量调节之间的代谢联系。
由于赖氨酸生物合成酶的点突变,AGD-2拟南芥突变体显示赖氨酸生物合成通量减少。该突变降低了植物的生长效率,也显著降低了TCA循环代谢物柠檬酸和调节代谢物肌醇和threhalose的水平。

植物中苯丙氨酸代谢的调节

苯丙氨酸(Phe)是植物中非常重要的氨基酸,是数千种对植物生长和人类健康至关重要的次生代谢物的前体。一个编码苯丙氨酸生物合成前两种酶的细菌基因的表达(图4;两个红色箭头)刺激拟南芥中苯丙氨酸和一些苯丙氨酸衍生的次级代谢物的产生(图5)。
合成苯基丙酮酸的PheA基因也可能促进与香气和风味相关的代谢物的产生。

植物代谢的动态群落

我们开发“网络”网站是为了建立一个以植物新陈代谢为主要焦点的动态社区http://metwork.weizmann.ac.il

一种新的生物信息学工具来研究分支代谢途径的调控

与酶相关基因表达程序分支的代谢网络很难研究,因为这些基因可能是积极的还是消极的监管在不同条件下的两个分支是活跃的或者一个是活跃的,一个是镇压,分别(见图右侧描绘基因1和2,以协同的方式调节代谢物X向代谢物Y或向代谢物Z或同时向代谢物Y和Z的转换)。
我们开发了一种专门的生物信息学工具来研究与分支代谢途径相关的基因表达网络,目前正在利用该工具研究拟南芥中编码整套转录因子和代谢酶的基因的协同表达网络。

与自噬相关的新植物蛋白

自噬是一个与生长和对各种环境和生理应激的反应有关的多功能细胞生物学过程。我们已经鉴定了三种植物特异性蛋白(称为AAP1 - AAP-3),它们与Atg8f相互作用,Atg8f是自噬机制中的一种核心多功能蛋白。AAP1似乎定位于被内质网包围的细胞核。它在细胞核中的作用尚不清楚。