אגף תפעולהוקם בשנת 2011 במטרה לאחד תחת מטרייה אחת את התחומים: הובלות, דואר, ביטחון, חירום, נראות ואיכות הסביבה, מינהל מדענים אורחים, דיור סטודנטים, אולמות, בתי אירוח, מסעדות, רכב, תחבורה וגינון.
עובדיאגף תפעולמעניקים שירות לכלל המחלקות המדעיות, האגפים המנהליים והדיירים במכון ויצמן למדע.
עובדיאגף תפעולרואים עצמם מחויבים להעניק ללקוחותיהם שירות אישי ואיכותי המושתת על הגינות, מהירות, יעילות, מקצועיות, כבוד ואכפתיות.