研究

蜂窝决策中的信号处理

• 开发系统级框架以在单个单元格级别表征信号集成
• 定义感知和综合刺激集成在确定蜂窝命运中的作用
• 分析BMP /TGFβ路径中的多配体信息处理及其对间充质干细胞分化的影响
• 造血和免疫应答中Jak / Stat途径中的信号处理

开发中编程的细胞死亡和细胞破坏机制

1. 果蝇依赖性非致死细胞方法（CDPS）在果蝇中：
   • 精子终端分化
   • 抑制不需要的细胞迁移和侵袭
2. 果蝇开发中的Caspase - 独立式替代细胞死亡途径（ACDS）
   • 在成年男性中的动物胚细胞形成期间生殖细胞死亡（GCD）
   • 胚胎中生殖细胞规格期间的原始生殖细胞（PGC）死亡
3. 果蝇精子线粒体的结构(Nebenkern)
4. 在果蝇施肥后的父母线粒体破坏

生物电路原理

• 生物电路是蜂窝信息处理的构建块：引导其设计，功能和演化的原理是什么？
• 基本生物过程如基因表达依赖于少数，因此随机不可预测的方式变化。可变异性在信息处理中的作用是什么以及哪些机制确保胚胎图案化等过程的鲁棒性？
• 转录和复制竞争相同的DNA模板，并依赖于一般和特定监管因素的组合作用。这些过程如何协调以及它们如何互相通信？

骨质体中的细胞信号传导：健康和疾病中的骨骼

• 我们研究破骨细胞是如何形成的，以及它们是如何工作的。破骨细胞是我们身体中唯一可以降解骨骼的细胞
• 我们的研究直接与骨生物学和人类疾病联系在内，包括骨质疏松症，骨质病变和癌症骨质流失
• 我们的研究结合了分子、细胞和整个生物体(小鼠模型)水平
• 我们的目标是解释单个信号分子和过程如何调节正常生理，它们如何导致疾病，以及它们如何用于治疗疾病

细胞内和细胞间mRNA转运和蛋白质定位

• 酵母和哺乳动物细胞中mrna的标记和活成像
• mrna的亲和纯化及rna结合蛋白和共转运mrna的鉴定
• 评估RNA结合蛋白在蛋白质定位和细胞生理中的作用
• mRNA定位和RNA-RNA和RNA-蛋白质相互作用的基因组映射

人类进化与基因调控

• 是什么基因改变使我们成为人类?
• 人体特异性疾病的起源是什么？
• 我们如何从遗传数据计算地推断出特征？

• ？人类适应的遗传基础是什么？

开发与疾病中的Runx转录因子

• 调节元素赋予时间和组织特异性润落转录因子的特异性表达
• Runx3是TrkC神经元的靶基因
• Runx3在肠道巨噬细胞和树突状细胞中的功能
• Runx1通过转录调节巨核细胞成熟和肌细胞增殖

生物结晶机制

• 研究模型生物（斑马鱼，MEDAKA）和异国情调（COPEPODS，Chameleon，Geckos）中晶体形成细胞的开发和细胞生物学。
• 研究病理结晶（即痛风疾病和肾结石）并开发新的治疗方法。
• 发现并描述新的生物晶体。
• 研究新型晶体生物光学系统。

多能干细胞与表观遗传学

• 成熟分化的细胞如何恢复为胚胎多能状态？
• 如何对胚胎多能性的不同口味影响干细胞的分化潜力
• 在早期发育过程中，调控谱系承诺程序及时执行的关键表观遗传途径是什么?
• 为什么Totipotent或原始生殖细胞仅保留胚胎干细胞的一些性质？

调节RNA在大脑完整性和神经退化

• 我们是RNA生物学家，寻求了解终身组织中的RNA功能：运动神经元和β细胞。
• 长期兴趣是在神经变性上，重点是ALS。我们的研究跨越基本分子机制转化/临床研究。
• 人类基因组学，转录组织和近距离蛋白质组学驱动电流项目：

(i)终身细胞中特定的非编码rna和调控途径

（ii）失代偿的MicroRNA生物发生导致ALS发病机制

(iii)寻找人类渐冻症基因组学驱动渐冻症的非编码突变

(iv)神经变性的无细胞RNA生物标志物

(v)内分泌胰腺中失配基因的沉默

（vi）MicroRNA对成人β细胞稳态和细胞可塑性的贡献

多胺在支持细胞功能中的作用

• 多胺与细胞增殖
• 多胺在调节翻译中的作用
• 从多胺生物合成途径降解蛋白质的机理

发育和疾病过程中程序性细胞死亡的蛋白质相互作用图

• 在实时监测沿着自噬和凋亡途径的蛋白质 - 蛋白质相互作用的全局概况
• 全基因组功能屏幕识别编程细胞死亡的替代形式的驱动程序
• 胚胎干细胞分化中RNA翻译的非典型模式
• 哺乳动物胚胎中细胞死亡机制
• 识别患者肿瘤细胞的死亡特征和精准癌症治疗的易损点

细菌组合组装

• 我们研究了调节细菌社区的单细胞间和多细胞之间的过渡的决策过程
• 我们的目的是在细菌社区中寻找抗生素抗性的新途径，并瞄准它们
• 我们研究的分子机制，使有益的细菌群落保护他们的宿主

系统生物学，医学和原生生产

• 系统生物学和系统医学套件数据库：Genecards，Malacards和Pathcards
• 基因调控元件及其靶基因的综合观点
• 系统原生生物学:在没有RNA的脂质催化网络中的生命起源
• 用晶形来解密遗传疾病，整个基因组序列表型解释工具

RNA病毒的分子和细胞生物学

• 包括Corona，Zika和Dengue在内的RNA病毒是对人类健康的重大威胁。我们研究RNA病毒如何与其宿主细胞相互作用并将其转化为病毒制造业。
• 我们的主要模型是肠病毒 - 常见的病毒病原体导致人类严重的医疗并发症，没有可用的治疗治疗方法。
• 我们调查肠道病毒如何改造宿主细胞器的结构和功能，以产生有利于病毒复制的环境。
• 我们解决的另一个关键问题是肠道病毒的方式，只表达少量蛋白质，患有复杂的蛋白质机械的人细胞。我们研究了病毒蛋白的不同作用以及他们用于劫持宿主机械的机制。
• 我们的目标是将肠道病毒复制的完整计划划分在一起。这可能导致新的抗病毒治疗方法的发展。

保护与变化的计算生物学

基因组进化与系统生物学

• 基因组和基因表达调控网络的演变
• 癌症基因组，转录组和蛋白质组
• 翻译调控的系统和基因组生物学
• 细胞对环境的反应生理学
• 人类的演变

健康与疾病的皮质发育

• 了解塑造发育中的人类皮层的分子和细胞事件
• 研究神经发育疾病导致基因的功能
• 开发人类神经发育障碍的小鼠模型
• 应用“疾病”研究人胚胎细胞衍生的脑器有机体的方法

白葫芦链接ER应力和氧化应激

• 内质网（ER）应力和细胞毒性剂通过基于微粒体谷胱甘肽S转移酶2（MGST2）激活生物合成途径来引发白三烯C4（LTC4）的生物合成
• 反过来，LTC4通过NADPH氧化酶4（NOX4）核易位来触发氧化应激和DNA损伤
• LTC4抑制剂，作为哮喘药物缓解化疗药物的细胞毒性

细胞器系统细胞生物学

• 寻找酵母中未研究的蛋白质的功能
• 了解细胞器的功能
• 研究蛋白质如何靶向并转移到内质网、线粒体和过氧化物酶体
• 揭示新的接触地点，它们的培养蛋白和功能
• 关注过氧化物酶体，细胞的代谢中枢

破解eptrackscriptome

• 定位和表征mRNA上不断增长的转录后修饰库(“转录组”)
• 解读转录后修饰在调节mRNA命运（定位/稳定性/翻译）和细胞生理学方面的功能
• 解剖MRNA修改法案的机制
• 分子生物学，遗传学和计算生物学的跨学科整合

分子病毒学和细胞生物学

• 使用HBV和PY病毒作为模型，了解病毒 - 宿主相互作用的分子基础
• 非受体酪氨酸激酶在细胞命运测定中DNA损伤和河马途径中的作用
• 内在无序蛋白质（IDPS）的蛋白酶体降解过程

果蝇发育信号和细胞生物学之间的界面

• 强大的胚胎发育模式
• 分泌囊泡中的Actomyosin动力学
• 分泌器官的代偿性内吞作用

微生物基因组学和系统生物学

• CRISPR，微生物抗噬菌体免疫系统
• 细菌和噬菌体之间的军备竞赛
• 病毒之间的通信
• RNA介导的微生物调节
• 微生物基因组进化

分析病毒感染

• 病毒如何与控制基因表达的植物途径和征兆
• 揭示病毒-宿主相互作用的新方面，以及揭示新的细胞生物学原理
• 解密作用不同病毒元素在感染期间正在播放

条纹肌肉的发展和细胞生物学

• 肌核的结构和表观遗传学
• 肌肉收缩过程中肌核的动态
• 肌纤维的机械转导和细胞周期进展

肌肉骨骼的发育、再生和病理学

• 我们的主要目标是了解控制肌肉骨骼发育和功能、维护和再生以及老化和病理的生物学和生物力学原理
• 我们研究肌肉骨骼装配，即系统各组成部分之间的物理附着体的创建，重点关注附着体的独特过渡组织，肌腱和骨之间的附着部位
• 我们研究了控制肌肉动作的本体感觉力学传感器在肌肉骨骼维持和疾病中的作用，包括脊柱侧弯、髋关节发育不良(DDH)和骨折修复
• 通过使用高级成像模态，高通量计算机视觉算法和用于分析时间系列3D图像的计算模型，研究塑造每个骨骼的独特和复杂三维形态的机制