分子遗传学部的生物信息学
随着下一代测序(NGS)技术的出现,在不使用生物信息学的情况下,几乎不可能进行生物学研究。作为部门生物信息管理员,我的努力致力于促进和支持使用计算工具进行先进的生物学研究。我在这里通过实验设计以及在解释中提供帮助和培训部门成员。我的专业知识包括在其他方面,分析NGS的各种应用:遗传变异检测,RNA-SEQ和De-Novo组装。由于NGS实验的分析始终只是起点,我提供了讨论和头脑风暴的指导,讨论和头脑风暴将致力于对数据的生物学理解的下游分析。
资源:下一代序列分析高度密集,需要高功率的计算机。该部门配备了3台计算机节点,允许总访问768 GB内存。节点是Wexac超级计算机的一部分,旨在并行运行作业。
软件:专用PC站,位于Meyer Building的406A室旁边,可供使用。PC站包含许多有用的工具,例如Partek用于聚类和PCA分析;Persaus分析质量规范数据;多次对准和序列分析的工具;Mobaxterm,打开Unix界面等。
分子遗传学部的生物信息学
随着下一代测序(NGS)技术的出现,在不使用生物信息学的情况下,几乎不可能进行生物学研究。作为部门生物信息管理员,我的努力致力于促进和支持使用计算工具进行先进的生物学研究。我在这里通过实验设计以及在解释中提供帮助和培训部门成员。我的专业知识包括在其他方面,分析NGS的各种应用:遗传变异检测,RNA-SEQ和De-Novo组装。由于NGS实验的分析始终只是起点,我提供了讨论和头脑风暴的指导,讨论和头脑风暴将致力于对数据的生物学理解的下游分析。
资源:下一代序列分析高度密集,需要高功率的计算机。该部门配备了3台计算机节点,允许总访问768 GB内存。节点是Wexac超级计算机的一部分,旨在并行运行作业。
软件:专用PC站,位于Meyer Building的406A室旁边,可供使用。PC站包含许多有用的工具,例如Partek用于聚类和PCA分析;Persaus分析质量规范数据;多次对准和序列分析的工具;Mobaxterm,打开Unix界面等。